Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms