Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2bP67871 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms