Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39P62892 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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