Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl30P62889 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms