Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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