Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms