Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms