Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms