Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Irf5P56477 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Irf5P56477 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf5P56477 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Irf5P56477 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Irf5P56477 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irf5P56477 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irf5P56477 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Irf5P56477 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irf5P56477 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Irf5P56477 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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