Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtswP56203 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtswP56203 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtswP56203 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms