Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PctpP53808 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PctpP53808 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PctpP53808 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PctpP53808 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PctpP53808 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PctpP53808 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PctpP53808 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PctpP53808 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms