Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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