Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa11P50709 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa11P50709 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms