Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa6P50704 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms