Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FmodP50608 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
FmodP50608 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms