Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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