Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HpdP49429 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HpdP49429 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HpdP49429 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HpdP49429 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms