Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rfx2P48379 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rfx2P48379 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rfx2P48379 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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