Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VdrP48281 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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VdrP48281 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VdrP48281 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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