Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms