Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms