Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms