Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VhlP40338 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms