Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cap1P40124 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cap1P40124 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cap1P40124 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cap1P40124 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cap1P40124 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cap1P40124 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cap1P40124 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cap1P40124 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cap1P40124 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cap1P40124 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cap1P40124 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cap1P40124 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms