Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms