Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprkP35822 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms