Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms