Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms