Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
VtnP29788 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VtnP29788 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VtnP29788 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VtnP29788 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms