Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PtprmP28828 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PtprmP28828 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PtprmP28828 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PtprmP28828 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PtprmP28828 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms