Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms