Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.4 ms