Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms