Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CftrP26361 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CftrP26361 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CftrP26361 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CftrP26361 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CftrP26361 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CftrP26361 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CftrP26361 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CftrP26361 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CftrP26361 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CftrP26361 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CftrP26361 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CftrP26361 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms