Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsta3P23591 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms