Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmnb2P21619 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmnb2P21619 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms