Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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