Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a2P20490 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms