Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Fcer1aP20489 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Fcer1aP20489 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Fcer1aP20489 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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