Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaraP11416 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaraP11416 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaraP11416 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RaraP11416 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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