Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem254bP0DN90 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms