Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04214 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P04214 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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