Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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