Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mtnd1P03888 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms