Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01747 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01747 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01747 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01747 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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