Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01727 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01727 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01727 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms