Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms