Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcn4O70507 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms