Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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BckdkO55028 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BckdkO55028 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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