Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlkO54988 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms